1、根据鳞片的差异，锦鲤可分为两大类，即普通鳞片型和无鳞或少鳞型。无鳞或少鳞型的锦鲤称为德国系统锦鲤，是由德国引进的无鳞的革鲤和少鳞的镜鲤与日本锦鲤杂交而培育出的品种。
2、根据斑纹的颜色分为三大类，即单色类，如黄金等；双色如红白、写鲤等；三色类如大正三色、昭和三色等。日本爱鳞会将锦鲤分成13大类，每类又根据锦鲤体表色彩和斑纹的不同分为很多品种，具体分类见下：红白、大正三色、昭和三色、黄金、花纹皮光鲤、别甲、写鲤、光写、浅黄、衣、丹顶、金银鳞。
