放进冰箱冷藏。龙眼比较适合在4-6摄氏度的环境下冷藏保存，在这个温度下，龙眼有生命可以呼吸，却消耗很少的能量。但不能放在密封塑料袋中保存，要用网状的保鲜袋来保存，以利于呼吸。新鲜桂圆果皮较软，也不可堆太多层，保存至冰箱前最好将果皮风干，装在保温盒中，或者用保鲜膜、保鲜袋封存，再放到冰箱里。
纸盒保存：新鲜的桂圆可以直接风干表皮后，放在能透气的纸盒中，然后储藏在通风、阴凉并且比较干燥的地方，如果桂圆太多，可以用纸板加强承压度，将桂圆分层隔开放置，避免桂圆底层压坏，流出汁水提前变质，这样还会导致大面积的损坏，如果空间较多，可以将桂圆直接平铺放置，也能避免桂圆的相互挤压。
速冻保存：在1小时内把龙眼果实的温度降到-30℃，并长期贮于-18℃环境中。果实能保持原来外观和固有风味，营养成分损失少。食用时先用冷水解冻，马上食用。
晒干保存：如果购买的龙眼比较多也可以选择把新鲜的桂圆拿去晒干，保存起来。晒干的桂圆保存的时间比较长，而且也会别有一番风味。晒干的桂圆应放在箱子里，用塑料盖起来，然后放在阴凉处，要经常查看下预防发霉、虫蛀等。
