厕所里的上水水源和厨房里的上水水源一样，都是自来水，应该是一样的。自来水是指通过自来水处理厂净化、消毒后生产出来的符合相应标准的供人们生活、生产使用的水。生活用水主要通过水厂的取水泵站汲取江河湖泊及地下水，地表水，由自来水厂按照《国家生活饮用水相关卫生标准》，经过沉淀、消毒、过滤等工艺流程的处理，最后通过配水泵站输送到各个用户。
很多地区新建的小区要求设置中水系统，设置了中水系统的小区卫生间的马桶用水的水源是中水，中水是将废水无害化处理得来的，是不能食用的，只能用来冲厕所。
