历史记载秦琼有两个儿子和三个孙子。两个儿子一个姓名不详,官至右卫左郎将,娶尉迟宝琳女。一个名为秦怀道,生于625年,死于684年2月21日,字理,秦琼死时秦怀道14岁。
记载有三个孙子,分别为秦景倩,越州山阴县令。秦佾,出生年不详,死于698年,潞州司法参军。秦利见,许州鄢陵县丞。
秦琼,字叔宝,齐州历城人,隋末唐初名将。唐统一后,秦琼久病缠身,于贞观十二年病逝。生前官至左武卫大将军、翼国公,死后追赠为徐州都督、胡国公,谥曰“壮”。贞观十七年被列入凌烟阁二十四功臣。