碱基是指嘌呤和嘧啶的衍生物，是核酸、核苷、核苷酸的成分。包括五种组成脱氧核苷酸及核糖核苷酸的嘧啶，腺嘌呤，鸟嘌呤，尿嘧啶以及5胞嘧啶甲基，5羟甲基胞嘧啶，5胞嘧啶甲酰，5胞嘧啶羧基等稀有碱基。
碱基通过互补原则，即鸟嘌呤与胞嘧啶配对，腺嘌呤与胸腺嘧啶配对或腺嘌呤与尿嘧啶配对，来组成脱氧核苷酸或核糖核苷酸。以此指导生物体的遗传信息的遗传及体内信息素的释放传递。
碱基还构成一些生命必须物质或是重要的辅酶，如三磷酸鸟苷，腺苷，乙酰辅酶等，对生命活动的作用非常大。
