在学术上两者关系很好，在政治上处于敌对关系。
作为同乡，蔡元培对鲁迅是有着知遇之恩的。鲁迅在教育部、北大的任职都得到了蔡元培的帮助。然而鲁迅与蔡元培这位前辈同乡，在思想上却逐渐变成了“两股道上跑的车”1926年蔡元培任国民党中央监察委员后，倡导“潜心研究与冷眼观察”，这与民主战士鲁迅的呐喊背道而驰。《无花的蔷薇》中点名批评这位“孑公”也是二人关系最为僵硬的阶段。鲁迅在给江绍原的信中说：“其实，我和此公，气味不相投者也。
鲁迅原名周樟寿，1898年改为周树人，笔名鲁迅，字豫山、豫亭，后改名为豫才。20世纪中国重要作家，新文化运动的领导人、左翼文化运动的支持者，是现代文学家、思想家、革命家。
蔡元培字鹤卿，又字仲申、民友、孑民，乳名阿培，并曾化名蔡振、周子余，汉族，浙江绍兴山阴县人，原籍浙江诸暨。革命家、教育家、政治家。
