1、培养方向不同:根据我国的有关规定，普通硕士教育以培养教学和科研人才为主，授予学位的类型主要是学术型学位；而专业硕士是具有职业背景的硕士学位，为培养特定职业高层次专门人才而设置；
2、招生条件不同:专业硕士要求报考者有一定年限的工作经历，而普通硕士则不需要。绝大多数专业硕士还要求在职人员报考需要经所在单位或相应管理部门的同意，有的甚至要求所在单位推荐等；
3、招生考试不同:对学生来说，普通硕士的招生考试只有年初的统考，而统考以外的专业考试则由各招生单位自行命题阅卷。专业硕士的招生考试有十月份的联考和年初的统考两次机会，考生可以自行选择，而这两大国家级别的考试的专业考试，也由各招生单位自行命题阅卷。
