1、概念不同。经济适用房的主要销售对象为中低收入家庭，购买这类房可以享受税费减免的优惠政策，在中低收入家庭的经济承受范围内，是一种保障性住房。而商品房是由房地产开发商负责开发的房产项目，出售时按市场规律进行。
2、价格不同经济适用房在出售时，严格按照政府指导价进行定价，同时政府在经济适用房的建造过程中，提供了用地、资金等方面的扶持，降低了经济适用房的出售价格，但商品房在出售时，完全按照房地产市场的情况进行定价。
3、质量不同经济适用房在建造的过程中以经济、适用为主，房屋功能齐全，满足家庭的基本生活需求，重点突出实惠二字，而商品房除了考虑到实用性，还考虑到了房屋的装饰性、区域性等方面，讲究的是房子的设计理念。
4、权利不同经济适用房是由国家统一进行规划的，购买此类房屋时，购房者可以免征土地出让金等费用，因此房价远远低于商品房，但经济适用房的产权人只拥有房屋的使用权，无法享受到房屋的收益权，如果将房屋上市进行交易，必须补交各种税费，而商品房的产权人拥有房屋的完全产权。
总而言之，经济适用房属于保障性住房，比较适合中低收入家庭，而商品房完全按房地产市场情况进行定价，对购房者的经济条件要求更高。
