种子可呈圆形、圆柱形、椭圆、扁圆、凹圆形，每荚2～10颗，多为青绿色，也有黄白、红、玫瑰、褐、黑等颜色的品种。可根据表皮分为皱皮及圆粒，干后变为黄色。种子的颜色有红、黄、绿、黑、白、紫、灰等多种多样，1公斤芝麻竟有25万粒之多。但是，就植物的种子来说，比芝麻小的还多着呢。5万粒芝麻的种子，有200克重，可是5万粒烟草的种子，只有7克重。四季海棠的种子还要小，5万粒只有0.25克。一粒小小的芝麻，比一粒四季海棠种子要重近千倍。但是，别以为这是最小的植物种子。有一种植物叫斑叶兰，它的种子小得简直象灰尘一样，5万粒种子只有0.025克重，1亿粒斑叶兰种子才1两重。人们至今还没有发现比这更小的种子。
