沪通铁路长江大桥北端建在南通九圩港,南端建在张家港十三圩。
沪通铁路长江大桥的北端北端建在南通九圩港,其采用公铁合建,桥址位于长江下游澄通河段南通水道进口段,沪通铁路长江大桥设计长约11公里,其中跨江部分长5.3公里,铁路为四线,公路为六车道。
沪通铁路长江大桥南端建在张家港十三圩港闸下游约400m处,垂直主航道的方向跨越长江,于江中横港暗沙稍向东偏转,跨越北岸天生港水道,于南通捕鱼港下游约200m处登陆,沿东北方向前行。