历时四年在天津拍摄。
2007年11月28日,在天津进行拍摄的陆川《南京!南京!》首次对媒体开放探班,导演陆川接受了记者采访,表示最大的心愿是将来影片上映后不仅中国观众能看到,日本观众也能看到。那天拍摄的是历史上记载的日军向南京安全区委员会所要妇女的事件。场景被安排在一个教堂里进行,近两三百名群众演员年龄从几岁到六七十岁,衣着褴褛地站在现场等待陆川指使。