加强饲养管理，经常维持较强的群势，做好蜂群的保温，是预防此病的前提。为了减少病毒对幼虫连续感染，可利用蜂群从分群到新王产卵这段时间的断子期，或人为地幽闭蜂王，造成一段时间的断子期，来打断囊状幼虫病的流行环节。这是预防此病的重要手段，另外，在野外花粉不多的发病季节，用少量酵母片或维生素B加入糖浆饲喂蜂群，也有较好的预防效果。在平时，注意选择抗病力强的强群培育蜂王，以更换病群的蜂王，可以大大提高蜂群的抗病力。另外，中蜂囊状幼虫病的病原不耐高温，蜂具和蜂蜜可用煮沸消毒。蜂箱清洗干净后晒干，再用硫磺烟熏10~15分钟，也能达到消毒的目的。
药物防治，可随意采用下列中一种：
1、半枝莲狭叶韩信草、向天盏、探耳草、：用干草一两，加入适量清水，先以猛火煮沸，继以微火续煎15~20分钟，滤渣后，趁热配成浓糖浆，于傍晚可喂8~10框蜂。每隔5~7天喂一次。
2、雄蒜醇合剂：每10框蜂，用精筛雄黄1克、鲜蒜6~8克，捣碎成泥，加75%乙醇酒精、10毫升，再加蒸馏水40毫升，装入广口瓶内摇匀备用。使用时，将蜂抖入箱底，用清洁的手提喷雾器装进药液，对脾喷雾，每脾两面各喷3~4下，放回原处。喷脾后第三天，病虫尸即被工蜂拖光。
3、用马鞭草1两、墨旱莲1两、大蒜头半两，加入适量水煎煮后，过滤去渣，按1：1配入白糖溶化，可喂10框蜂。每隔三天喂一次。
4、用马鞭草1两、积雪草1两、车前草1两、刺苋半两，加入适量水蒸煮后，过滤去渣，按1：1配入白糖溶化，可喂10框蜂。每隔三天喂一次，直至病好为止。
5、病毒灵：每框蜂用半片，严重的每框用一片，溶解后配入浓糖浆，每隔3-5天喂一次，直至病好为止。
