海胆一般都有毒的，在食用之前需要进行一系列的去毒工作，科学合理的食用可以预防中毒；
在海胆中有两种产生毒素的器官：叉棘和棘，在生殖季节摄食海胆的生殖腺和卵巢或被棘或叉棘鳌刺会引起中毒，已报道过的白棘三列海胆、球海胆、毒海胆、石笔海胆等数十种海胆都是有毒的，海胆毒素的作用各不相同，有的对动物可引起呼吸困难、肌肉麻痹、抽搐以至死亡，有的对动物红细胞有溶解作用，并能引起心脏的激活和使肌肉对非直接性刺激不起反应，具有潜在的药用价值。
