整个红海平均深度558米，最大深度2514米。
红海是年轻的海。大约2000万年前，阿拉伯半岛与非洲分开，诞生了红海。现在还可看出，两岸的形状很相似，这是大陆被撕开留下的痕迹。非洲板块与印度洋板块间的裂谷，沿红海底中间通过。在近300万到400万年来，两个板块仍继续分裂，两岸平均每年以2、2厘米的速度向外扩张。红海在不断加宽，将来可能成为新的大洋。是印度洋的陆间海，实际是东非大裂谷的北部延伸。按海底扩张和板块构造理论，认为红海和亚丁湾是海洋的雏形。据研究，红海底部确属海洋性的硅镁层岩石，在海底轴部也有如大洋中脊的水平错断的长裂缝，并被破裂带连接起来。
