印尼政府和“自由亚齐运动”在赫尔辛基正式签署和平协议。根据协议,“自由亚齐运动”不再要求亚齐独立并解除武装。同时,政府撤出在亚齐的编制外驻军和警察,特赦“自由亚齐运动”政治犯。2005年8月31日,印尼政府释放了在押的1424名“自由亚齐运动”政治犯。2006年7月,印度尼西亚国会通过了《亚齐自治法》,赋予亚齐省地方政府更大的自治权。根据《亚齐自治法》,亚齐开发石油和天然气收入的百分之70将由本省支配。该法还规定曾经从事分离主义活动的人可以组建政党,并参加各级政府竞选。