菠萝蜜冻了颜色变深后不能吃。因为冷冻后颜色变深是时间过长引起，冷冻导致菠萝蜜中的营养成分及水分大量流失，解冻后口感也会变差，而且吃冷冻后的菠萝蜜容易伤脾胃，导致人出现腹泻、腹痛的症状。因此菠萝蜜最好是剥多少吃多少，吃不完的尽量冷藏保存。
菠萝蜜中含有丰富的糖类物质，很容易滋生细菌而腐坏，保存时间并不长，其保存时间和保存方式有一定的关系，如果是将它直接置于阴凉处保存的话，一般只能保存3天左右；如果是放在冰箱保存，应先用食用级别的保鲜膜包裹在横切截面，再放入冷藏。
