1、直接还田。直接还田是将秸秆粉碎、留高茬还田、田面覆盖等方式，其中粉碎还田是将秸秆用机械粉碎后直接还田，适用于玉米和稻麦秸秆。而留高茬还田是将稻麦收割时留30厘米左右，再用返转灭茬机械一次完成旋耕、灭茬还田。田面覆盖还田则是将秸秆切割成10厘米左右，在播种后均匀铺在作物行间，不留空地、不成堆。
2、过腹还田。秸秆作为最为常见的饲料，可以用其饲喂家禽牲畜后，经过消化吸收后，粪便可以作为肥料还田，这种方法不能能节约饲料量和牧草，还能提高土壤肥力，是最为经济环保的方法。
3、堆沤还田。可以利用秸秆制作堆沤肥、沼气肥，或者用微生物发酵生产腐熟肥，将秸秆与畜禽粪积制，粪与草隔层堆积压实，发酵腐熟。这样生产出的腐熟肥有机肥含量高，施肥效果较好，但是劳动量大。而微生物发酵则是将秸秆和塘泥或人粪尿置于积水坑中，经过微生物发酵后形成的肥料。
