区别如下：
1、性质不同。前者是营利性组织，其目的是通过提供教育培训服务而获取经济利益；后者是非营利性组织或者说是基本非营利性组织，其目的是培养社会主义建设事业的各类人才。
2、产权归属不同。前者在财产归属上受公司法、民法等法律的调整。在民办培训机构终止、清算后，民办培训机构的投资人可以依法在清偿债务后取得剩余财产；后者属于公益性组织，原则上应当遵循公益性组织运作的基本原则和规则，其财产权本质是属于社会公共财产。
3、登记机关不同。前者的登记机关是工商行政管理部门；后者依照《民办非企业单位登记管理暂行条例》的规定，其登记机关应该是民政部门。登记机关的不同在一定程度上也反映了二者性质上的区别，在工商行政管理部门注册登记，形式上就属于营利性组织，应该遵守《公司法》等相关法律、法规的规定。
