杀菌工艺不同：巴氏奶一般是在72-85℃左右的温度下进行低温杀菌，经过巴氏杀菌后，牛奶中仍然保留了部分无害或有益菌及细菌芽孢，而常温奶一般是在135-150℃左右的温度下进行4-15秒左右的高温杀菌，这种杀菌较为彻底，完全可破坏生长的微生物和芽孢。保质期不同：巴氏奶中因为还含有一些菌，所以一般需要在4℃左右的低温下保存，且保质期较短(2-7天左右)，运输要求也较高;而常温奶不需要低温冷藏，且保质期较长(6-9个月)，运输要求也较短。
