绳文时代的居所是人们自己建造的竖穴式房屋,但也有利用自然山洞和岩下作为住处的,竖穴式的房屋是从地面下挖50公分左右,四周用几根木柱支撑屋顶。
绳纹早期的村落大都在丘陵和台地顶端或斜坡上,一般规模小,延续时间短,这是当时人们为了寻找食物不断迁徒的缘故。