小龙虾常年均可繁殖，其中以五月到九月月为高峰期。小龙虾雌雄异体，并且具有较显著的第二性征。可从腹部游泳肢形状加以区分，雄虾腹部第一游泳肢特化为交合刺，而雌虾第一游泳肢特化为纳精孔；其次，二者螯足具明显差别，雄性螯足粗大，螯足两端外侧有一明亮的红色疣状突起，而雌虾螯足比较小，疣状突起不明显；第三，雄虾螯足较雌虾粗大，个体也大于雌虾。
小龙虾的繁殖比较特殊，繁殖的大部分过程在洞穴中完成，故在平常的生产中难以见到抱卵虾。卵巢在交配后需两到五个个月方最后成熟，并进行排卵受精。受精卵为紫酱色，粘附于腹部游泳肢的刚毛上，抱卵虾经常将腹部贴近洞内积水，以保持卵处于湿润状态。
