snRNA，核内小分子RNA，参与mRNA加工，剪接和成熟。snoRNA，核仁小分子RNA，负责rRNA加工切割和修饰。端粒酶RNA，是染色体端粒的RNA序列，在具有端粒酶活性的细胞内，它的任务是作为反转录的模板然后加在端粒的末端以解决染色体因复制而变短的问题，这种酶在大多数细胞里是没有活性的，在某些肿瘤细胞，转化细胞，干细胞以及生殖细胞里活性较高。tmRNA，这种RNA比较特殊，兼具了mRNA和tRNA的特点。在细胞中参与一种特殊的翻译反应，即反式翻译。dsRNA，双链RNA，主要在RNAi中起作用。
