分居两年离婚的证据包括：
1、一方在外居住的房屋租赁合同；
2、双方签订的夫妻分居书面协议，一定是要书面的，口头协议必须对方承认；
3、一方向另一方发出的书面分居文书，最好是用快件性质邮寄，在备注栏里注明“分居”，并且保留邮寄凭证，从邮寄之日起到提起离婚期间属于夫妻分居时间；
4、双方来往的书信、电子邮件等能证明双方感情不和分居的事实；
5、证人证言，比如双方都认识的朋友或者亲戚。
《民事诉讼法》第六十三条规定：证据包括：
(一)当事人的陈述；
(二)书证；
(三)物证；
(四)视听资料；
(五)电子数据；
(六)证人证言；
(七)鉴定意见；
(八)勘验笔录。
