生物学的证据不断更新,准确的说法尚未提出。但大致的思路是一致的,,鲸起源于一种陆生中小型远古动物。早期人们认为鲸的祖先隶属偶蹄目动物,有人认为更类似猪,有人认为更类似河马类动物。不过最近的研究可能比较倾向于中兽,中兽属于踝节目,而踝节目又代表了早期有蹄类进化的主干。所以两类假说只是小出入,即起源分化时间的不同。