南京大学的工商管理专业，其企业管理是国家级重点学科，拥有现代工商管理实验室。该系教师近年来出版专著四十五部，主编全国统编教材六部，在国内外重要核心刊物上发表论文一百四十五篇，主持参与国家级科研项目十项，省级科研项目三十八项，获国家级奖四项，省部级奖六项。该系还设有企业战略研究所、人力资源管理战略研究所、数量经济研究所等研究机构。
