《奇皇后》的结局是太后死了,廉屏秀被百姓们乱棍打死,脱脱战死,奇皇后已经成为了一代女王,元顺帝则退居幕后养病,两人一起回到了北方的大草原。
几年过后,奇皇后已经成为了一代女王,元顺帝则退居幕后养病,又过了几年,元国叛军开始进攻,奇皇后派出脱脱与元国叛军对战,脱脱一去不复返,最后奇皇后听到了脱脱战死的消息,当初脱脱奔赴战场之前,曾经叮嘱奇皇后做好撤退的准备,若平乱失败,就带着元顺帝退到蒙古草原。十几年的战争和天灾,叛军四起,随时有可能杀到京城,奇皇后来到元顺帝身边,却告诉妥欢说脱脱战胜了。随后又说想回到北方的大草原,元朝开始的地方。妥欢当即明白了战事失利,只是承娘在安慰自己。却也回答说都听承娘的。