1983年5月16日国务院批准《杭州市城市建设总体规划》中重建雷峰塔被列入其中。
1991年12月15日中国及省、市风景园林学会在杭州召开了重建雷峰塔学术研讨会，提出了重建雷峰塔应按五代末期始建时的形式建造。
1999年8月，杭州西湖旅游南线“双景”工程协调小组成立；同年9月，雷峰塔景区建设正式启动。
2000年2月16日开始对雷峰塔遗址进行考古发掘，同年3月26日，由清华大学、浙江大学、同济大学、东南大学、浙江省建筑设计研究院、杭州园林建筑设计院分别对重建雷峰塔进行可行性研究和总体方案设计，并在湖畔居公开展示接受市民评议。 经过三轮的国内专家评审和杭州市民评议。
2000年11月16日最后确定采纳清华大学提供的设计方案——宋代重建的五层楼阁飞檐砖塔形式宝塔，采用钢结构在原址上重建雷峰塔。 雷峰塔于2000年12月26日奠基。
2001年2月15日发现雷峰塔地宫并于3月11日开挖地宫，经过一年多的紧张施工，终于在2002年10月25日竣工落成，11月1日正式对外开放。
