日本神话一般大致上可以分为两个阶段：
一个是以神话为背景的神代；另一个属于历史日本国时代。日本的神代可按照《记》《纪》的记载可分为三个舞台。分别是高天原、出云、日向这三个阶段。
第一阶段：高天原。主角应该是伊邪那歧尊和伊邪那美尊，由他们二神创造神土，诸神降生以及天岩户等故事发展而来高天原神氏，以日本天皇的神祖活动的天上世界的故事。
第二阶段：出云。主角就是我们熟悉的伊邪那歧尊和伊邪那美尊的三贵子。
第三阶段：日向。主角是琼琼杵尊和他的后裔日本的初代天皇，神武天皇。
大陆西域的文化传播使的日本也在知识方面呈现了多样性。而这个时代出现的神怪是为了提倡道德风尚和个人操守，而神怪也渐渐的吸收了中国的文化。使得日本的神话也变的丰富多彩。
