区别：
1、二本的本科院校一般都是省属单位，而三本的本科院校多为民办单位；
2、二本院校收费远远低于三本院校；
3、二本是本科证书，三本是独立学院证书；
本科即大学本科专业学历，是高等教育的基本组成部分，一般由大学或学院开展，极少部分高等职业院校已经开展应用型本科教育，本科教育重于理论上的专业化通识教育，应用型本科侧重于应用上的专业教育和实际技能教育，学生正常毕业后一般可获本科毕业证书和学士学位证书。
