1、无法办理房产证：有的回迁房，政府是不允许买卖的，有的能买卖，因此在购买此类房屋前，要了解清楚该房屋能否买卖。若是购买了不能买卖的房屋，那购买方是不能办理房产证的，更不可以把该房屋过户到自己的名下，另外也不能对该房屋进行转让、贷款等等。
2、易发生产权纠纷：若是该回迁房在出售后，房价上涨了许多，有部分出卖人便会感到后悔，想要反悔。有的出卖人会违约，会主张出售合同无效，那购买者就容易出现财产损失。尤其是所买的回迁房是不可转让买卖的，在这种情况下，购买方就难以保证自身权益。
3、居住安全难以保证：对于回迁房，有的业主会选择自住，也有的业主会选择出租、出售，这样在回迁楼中，流动人口就多，居住的安全性就较低，另外在物业、消防、卫生等方面都多少有一些的隐患。
