房屋按揭贷款尚未还清，抵押权仍存续有效，此时不能办理房产过户。抵押权属于定限物权，具有对抵押物所有权权能产生限制的作用，具有担保债权实现的作用，抵押权的保护优先于受让人所有权的保护，抵押存续期间，未经抵押权人同意，转让抵押房屋的，不发生物权变动效力。因此，受让人可以待出卖人还清抵押贷款后再办理过户登记手续，或者自己代出卖人清偿债务涤除抵押权再办理过户登记手续。因此，在房屋交易时，应当了解掌握房屋是否设定有抵押，如存在有抵押情形，决定是否交易以及选取何种方式办理产权的过户登记。在离婚案件中，如果所要分割的房屋有按揭贷款未还清，除符合《婚姻法司法解释三》第十条情形的，法院亦不能做出确认判决直接判决归属，而只能做出待抵押权消除后被告协助原告办理产权过户登记的给付判决。
法律依据：
《中华人民共和国物权法》第一百九十一条第二款
抵押期间，抵押人未经抵押权人同意，不得转让抵押财产，但受让人代为清偿债务消灭抵押权的除外。
