主要讲述了萌骑士团与暗黑大战之后的半年，陨石突然飞向萌学园，彗星小组却察觉到萌骑士队长艾瑞克竟随着陨石掉落到萌学园，大甜甜教员立刻展开对艾瑞克的治疗，随后萌骑士团通过团结努力守护萌学园、维护宇宙和平的故事。
《萌学园5：异界对决》，主演是李昂霖、林奕勋、阿本、刘书宏、彩虹姐姐、夏宇童、蝴蝶姐姐，导演为赖建国、老杨，编剧为陈美珊、马丽莎、阿本和温慧明。
