未成熟的青西红柿含有被称为龙葵碱的生物碱甙，其外形呈针状结晶体，对碱性非常稳定，但能够被酸水解。龙葵碱是一种有毒物质，大量吃未成熟的青西红柿之后，轻则口腔会有苦涩感，严重的可能会出现恶心、呕吐、头昏、流涎、乏力等食物中毒现象。因此，青西红柿不适宜做菜食用，若生食则危险性更大。
当青西红柿开始腐烂的时候，所含的龙葵碱会被破坏，而青西红柿成熟变红色之后，龙葵碱的含量就会大量减少至消失。但是，也有成熟后仍呈青色的西红柿品种。所以，完全没成熟的青西红柿不能食用。如果西红柿表面大部分呈红色，只一小部分有些青色则没有太大问题。
