硬度区别，野生的莲花菩提在大自然当中风吹雨打，生长速度缓慢，为了生存会自然而然地加强自身的密度，野生莲花菩提的硬度是可以与金刚菩提媲美的，而相比之下嫁接的莲花菩提虽然长得快，密度、硬度上面却不可同日而语，甚至用指甲去刻画，能够在表面留下印子。声音区别，野生的尼泊尔莲花菩提硬度够、重量大，在盘玩的时候珠子撞在一起，会发出十分清脆的撞击声，嫁接莲花菩提相互碰撞在一起时，声音就发沉、发闷。个头区别，野生的川谷生长环境较为恶劣，而且生长的周期长，结出的莲花菩提个头大小差异很大。嫁接的莲花菩提因为人工栽培，对大小能够很好地控制，往往同一批可以出大量个大、整齐、品相完好的菩提籽，如果是大批一公分直径以上的莲花菩提，一般都是嫁接出来的。
