君子兰可以自花授粉，自花授粉也能结果，但存在弊端。但根据张进祥先生《君子兰莳养知识问答》一书观点，君子兰宜远缘杂交，用同一植株上雄蕊花粉给雌蕊授粉或者用同一植株繁殖的后代互相授粉都属于近亲杂交，近亲杂交容易出现出苗率低，果实瘪小，品种退化等问题。
避免方法：保存君子兰花粉，找寻其他君子兰授粉。君子兰的花粉可以保存，君子兰花粉在一定条件下可长期贮存。在15摄氏度的常温下阴凉处，一周内使用有效率可达到百分百，在此期间可以寻找其他君子兰花粉来给君子兰授粉。
