1、本质：玛瑙是玉髓，未成玉的晶体矿物。它有玉的质地，但是不强。玛瑙质地表面光滑，而玉表面有些磨砂，也有些光滑。
2、颜色：玛瑙是晶体，透光性比玉好，所以玛瑙总会呈现亮晶晶的光芒，而且颜色也是丰富多彩。玉的颜色很少，有紫玉、绿玉，其他颜色很少见到，比较单调。所谓“千种玛瑙万种玉”便是说明了它们的颜色不一致性。
3、加工：玛瑙不易雕琢，因为它是晶体；玉则可以精雕细琢。
4、纹路：玉的结构致密、通透明亮，更容易分辨；而玛瑙是一种天然水晶类宝石，再加上各种独特的带状线花纹。这样的外观上两者差别也是较大的。
5、成分：玛瑙准确一点儿说它是矿物宝石，它的主要成分便是二氧化硅，也就是人们常说的石英，它在地球上的存量可不少，因此玛瑙也是在全球大部分的地区有产。而玉石，它的主要成分是含水的钙镁硅酸盐，这也就不难知道两者本质上便天差地别了。当然玛瑙也是玉石的一种，只不过它从属于中低档玉石。
