卫生协管员的主要工作任务有如下几项：
1、负责本乡镇，社区食品卫生，学校卫生，化妆品卫生，生活饮用水卫生，医疗卫生和公共场所卫生，职业放射卫生等摸底调查，建立本底资料档案。
2、协助区县卫生局卫生监督所开展本乡镇，社区医疗卫生和公共卫生领域日常监督检查。
3、开展本乡镇，社区卫生许可现场初步审查。
4、按照县卫生局的要求负责本乡镇，社区管理相对人卫生法律法规和基本卫生知识宣传。
5、按照县卫生监督机构的要求负责本乡镇，社区卫生监督相关信息的收集和报送。
6、负责本乡镇，社区群众举报投诉的登记，报告和协助县卫生局开展群众举报，突发公共卫生事件基本情况调查。
7、协助县卫生局卫生监督所参与本乡镇，社区卫生违法案件的初始调查和处理。
8、协助县卫生局卫生监督所在本乡镇，社区的卫生专项执法检查行动。
9、完成县卫生局交办的其他卫生监督工作。
