在上世纪60年代，哈尔滨工业大学开设了计算数学专业。1985年，在原有的计算数学专业与力学专业的基础上，组建了数学力学系，1987年正式建立了数学系。1977年开始招收数学师资班学员。1998年，根据教育部统一部署，哈工大数学系设置数学与应用数学、信息与计算科学两个本科专业。
数学系拥有1个数学博士后科研流动站，1个基础数学博士点，1个硕士学位数学一级学科授权点，2个黑龙江省重点本科专业。哈工大数学系是七个“全国工科数学课程教学基地”之一。
经过数学系全体教师的不懈的努力和不断的探索，使得整体教学水平和教学效果有了大幅度提高，已形成了群体优势。数学系现有一支以中青年教师为主、结构合理的学术队伍，在职教师71人，其中教授28名，副教授25名,博士生导师20名，国家教学名师1人，省级教学名师2人次，省杰出青年基金1人，4人荣获宝钢优秀教师奖，有7人为哈尔滨工业大学教学带头人。
