医疗纠纷案件起诉的方法是：
1、申请医疗事故鉴定：当事人可以向当地的医学会提出申请，当事人在提交相关材料后，医学会应该在45日内组织鉴定并得出鉴定结论。
2、收集相关证据：当事人可以将医院的就诊记录（病历、发票、病情证明、诊断报告、手术记录等等）作为证据固定下来。
3、向法院提起诉讼。向法院提起诉讼需要以下材料：
（1）民事起诉状。民事起诉状可以委托相关专业人士起草，也可以自行草拟，百度文库里面也有很多的模版可以参考。
（2）原、被告身份信息。被告信息个人难以调取，可以委托律师进行查询。
（3）相关证据。医疗事故鉴定报告、医院就诊记录等等。
【法律依据】
《民事诉讼法》第一百一十九条规定，起诉必须符合下列条件：
（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
（二）有明确的被告；
（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；
（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
