设置支付宝保护系统的方法是打开支付宝首页，登录支付宝账户，点击账户管理，点击账户设置，在账户设置的左侧一栏选择安全设置，找到安全保护问题，点击设置，页面会提示校验方式，完成校验后，即跳转至安全保护问题设置页面，然后设置安全保护问题，就设置完成了。
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