牛奶中含有很多的蛋白质，部分人对牛奶蛋白表现出过敏，这种现象随着喝纯牛奶的时间延长而加重，有些人免疫力差，牛奶喝多情况下容易出现皮肤过敏。牛奶中钙质的含量很高，但磷的含量更高，磷和钙质相互抑制，喝太多的牛奶起不到补钙之效，反而会引起缺钙。尤其是老年人，可能加重骨质疏松。牛奶中蛋白质的含量极高，在食用需要良好的胃肠功能消化吸收，对体内的乳糖酶、蛋白酶的消耗量比较大，长时间食用有可能会影响人的消化功能。牛奶在食用之后会产气，胃肠溃疡、胀气的人不适合饮用，以免加重症状。
