在正统道教神系中，玉皇大帝与西王母不是夫妻关系。
西王母是先天阴气凝聚而成，是所有女仙之首、掌管昆仑仙岛。所有男仙之首为先天阳气凝聚而成的东王公，其掌管蓬莱仙岛。玉皇为群仙之首，众神之主。西王母的出现比玉皇要早，所以他们不是夫妻。
玉皇大帝全称昊天金阙无上至尊自然妙有弥罗至真玉皇上帝，又称昊天通明宫玉皇大帝、玄穹高上玉皇大帝，居住在玉清宫。道教认为玉皇为众神之王，在道教神阶中修为境界不是最高，但神权最大。玉皇上帝除统领天、地、人三界神灵之外，还管理宇宙万物的兴隆衰败、吉凶祸福。所以他们并无直接关系。
