番茄秧子打蔫的原因是番茄秧子在移栽的时候根系受到了伤害，受伤的根系影响了番茄秧子的吸收功能，出现减少或者停止对吸收水分的情况，而叶片的水分还在持续蒸发，叶片持续失水会产生变软下垂、打蔫的现象，等根系恢复后叶片就能恢复正常，番茄秧子打蔫的现象就会消失了。
