对用不同的腌制方法加工的咸鸭蛋，有不同的保存方法：
用盐水腌制的咸蛋，不宜长期浸泡，应取出放在塑料袋内，置阴凉处。包泥腌制的咸蛋，应保持泥皮湿润，并置于阴凉处。以上两种办法，可使咸蛋半年内不坏。久存的咸鸭蛋，只要没有变质就不会对身体有害处，但是要注意保存的方法，咸鸭蛋虽然不易腐坏，但在保存时还要注意防止蛋内失水。咸鸭蛋一旦失水，蛋白就会发黑，咸度增加。
