1、僵苗。
僵苗是西瓜苗期主要的生理障碍。发生原因：苗床气温低，特别是土壤温度低，不能满足西瓜根系的基本温度要求。育苗床土质粘重，土壤含水量高，在湿度大、通风不良的根区条件下发根困难，根的吸收能力差，定植后连续阴雨，僵苗发生尤其严重。营养土配制不当。苗床或种植穴施用未经腐熟或未充分掺匀的有机肥而引起烧根或施用化肥过多，或化肥施于根部较近，土壤溶液浓度较高而伤根。
2、徒长苗。
发生原因：西瓜苗床光照不足，温度过高，土壤和空气湿度高，嫁接西瓜育苗过程中，砧木、接穗在温、光、气控制不当时，易出现徒长苗。徒长苗对低温适应性差，容易发生冻害。
3、沤根。
主要发生在幼苗根部或茎部，是西瓜育苗期常见的一种生理性病害。发生沤根时，根部不发新根或不定根，根部变褐后腐烂，子叶和新叶变薄，呈黄褐色或乳黄色，叶缘焦枯，地上部萎蔫。
