办理港澳通行证和办理护照是一样的。
根据《中华人民共和国普通护照和出入境通行证签发管理办法》相关条文的第三条:公安机关出入境管理机构应当参照国际技术标准，逐步推广签发含有电子芯片的普通护照，以下简称电子普通护照，提高护照的防伪性能。电子芯片存储普通护照的登记项目资料和持证人的面部肖像、指纹信息等。
