有20所本科大学。
厦门大学，是中华人民共和国教育部直属的副部级大学，教育部、福建省和厦门市共建高校，是世界一流大学建设高校。华侨大学，是国家重点建设大学、福建省重点建设高校、福建省高水平大学。福建农林大学，是全国建校最早的农林院校之一，是福建省重点建设3所高水平大学之一。福州大学，创建于1958年，国家“211工程”重点建设高校，国家“双一流”世界一流学科建设高校，中华人民共和国教育部与福建省人民政府共建高校。福建医科大学，是福建省重点建设高校、中国政府奖学金院校之一。
