有20所本科大学。
厦门大学,是中华人民共和国教育部直属的副部级大学,教育部、福建省和厦门市共建高校,是世界一流大学建设高校。华侨大学,是国家重点建设大学、福建省重点建设高校、福建省高水平大学。福建农林大学,是全国建校最早的农林院校之一,是福建省重点建设3所高水平大学之一。福州大学,创建于1958年,国家“211工程”重点建设高校,国家“双一流”世界一流学科建设高校,中华人民共和国教育部与福建省人民政府共建高校。福建医科大学,是福建省重点建设高校、中国政府奖学金院校之一。