1、颜色：
虽然南红玛瑙和红翡主色调都是红色，但是它们在颜色上还是有一些区别的。南红玛瑙颜色品种丰富多彩，主要有锦红、柿子红、玫瑰红、朱砂红和红白料等等，其中以锦红为最极品的颜色，十分少见。而红翡的常见颜色多为棕红色或暗红色，厚实而不通透，玉质偏粗，上乘的红翡翠颜色为“鸡冠红”，这种红非常鲜亮，玉质也细腻通透，是上乘红翡翠。因此，红翡翠的颜色比较鲜亮显轻浮，南红玛瑙的红色内敛显厚重，红翡翠通透感要略比南红玛瑙透。
2、内部结构
红翡翠与南红玛瑙在质地构成中有个比较明显的区别，就是天然南红玛瑙中有朱砂点，这些朱砂点有些用肉眼就可以看见，明显的是每个点都非常界限分明，不太明显的有些呈雾状分布，而红翡不具有这一特点，对于南红玛瑙朱砂点可以查看文章《关于南红玛瑙朱砂点的小知识》进一步了解。
3、评定标准
红翡的等级高低，则是以无杂质和杂色、色泽红艳鲜亮、通透性好为评价的核心条件。而南红玛瑙的优劣，主要是以色泽红润均匀、质地温润细腻、外表完整无痕、雕工精湛到位和体量够大够重为主要的评判标准。
