小智最强的6只神奇宝贝分别是大王燕、皮卡丘、喷火龙、烈焰猴、蜥蜴王、甲贺忍蛙，小智携带着这6只神奇宝贝，可以说是打遍天下无敌手了，
皮卡丘是小智收服的第一只神奇宝贝，也是跟随小智一辈子的神奇宝贝，拥有多年的战斗经验，越级挑战对他来说都是家常便饭了，早期的时候还打败了克制自己的岩属性的大岩蛇，后期皮卡丘还能自学技能，例如钢铁尾巴之类的。
大王燕是由傲骨燕进化而来，速度很快，而且大王燕的性格坚强，无论对手多么强大总能保持镇定，即便是威胁到自己的生命的攻击它也丝毫不受影响，小智收服它的时候费了很大的力气，尽管皮卡丘使出了十万伏特，大王燕并没有受到太多影响。
喷火龙大家都很熟悉了，也是小智早期的神奇宝贝，火恐龙进化后性格变得暴躁，不听话，但是随着故事的发展，喷火龙被小智感化逐渐被驯服，在战斗中还战胜了急冻鸟。
烈焰猴打败过真司的电击魔兽，一开始是处于下风的，但是在不断的挑衅下，烈焰猴被激怒性格变得狂躁，电击魔兽最终被击败。
蜥蜴王可以说是和喷火龙地位一样了，因为它也击败过传说中的神奇宝贝噩梦神，蜥蜴王是小智所有草系神奇宝贝中，成为最终形态的精灵。
甲贺忍蛙的机动性很强，和一般的同类相比，小智的这只可以说是顶尖的存在，凭借自己的指挥和甲贺忍蛙的头脑能让它在战斗中发挥的更加强大。
