沈阳药科大学的专业有药学、药物制剂、药物分析、药学、制药工程、环境科学、应用化学、药物化学、中药学、中药资源与开发、中药制药、葡萄与葡萄酒工程、中药学、生物工程、临床药学、生物技术制药、生命科学与技术基地班、工商管理、市场营销、国际贸易与经济、药事管理、生物医学工程。
药物制剂、中药学、药物分析、药物化学、生物技术制药都是特色专业，也是录取分数线相对较高的专业。
